Не смотря на то, что компания на упрощенной системе не платит НДС, она обязана заплатить НДС, если указала этот
налог в счете-фактуре (п. 5 ст. 173 НК РФ).
Однако статус «неплательщика» этого налога позволяет компаниям избегать ответственности за неуплату НДС.
На этом противоречии основан следующий способ налоговой экономии. Допустим, дружественная компания на
«упрощенке» выставляет счет-фактуру с НДС, но сам налог перечисляет в бюджет не сразу, а с большой отсрочкой. А контрагент возмещает эту сумму налога из бюджета — право на вычет подтвердил ВАС РФ в определении от 13.02.09 № ВАС-535/09. В целом дружественная группа компаний получитэко номическую выгоду в сумме возмещенного из бюджета НДС на время полученной отсрочки.
При проверке компанию или предпринимателя, применяющего спецрежим, обяжут перечислить сумму НДС в
бюджет. Но вот пени и штрафы налоговики начислить не имеют права. Суды признают такие меры незаконными.
Обоснование такое: за неуплату НДС и несдачу по нему деклараций нельзя наказывать организацию, которая по
закону не является плательщиком этого налога (постановление Президиума ВАС РФ от 14.02.06 № 11670/05,
постановления федеральных Арбитражных Судов Поволжского от 02.02.09 № А57-11858/06, Западно-
Сибирского от 15.04.08 № Ф04-2473/2008(3806-А81-43), Уральского от 26.03.08 № Ф09-1826/08-С2 округов и др.).
Хотя ради справедливости следует сказать, что есть и противоположные решения (к примеру, постановления
федеральных Арбитражных Судов Поволжского от 13.09.07 № А65-50/2007-СА2-41, Восточно-Сибирского от 08.11.06 № А33- 11936/06-Ф02-5948/06-С1 округов).
