Предпринимателю не выгодно осуществлять официальные выплаты по больничному. Дело в том, что пособия по временной нетрудоспособности, в том числе выплачиваемые индивидуальному предпринимателю, добровольно вступившему в отношения по обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством, облагаются НДФЛ (Письмо Минфина России от 27.06.2012 N 03-04-05/3-780).

Согласно ч. 3 ст. 2 Федерального закона от 29.12.2006 N 255-ФЗ «Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством» (далее — Федеральный закон) индивидуальные предприниматели подлежат обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством в случае, если они добровольно вступили в отношения по обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством и уплачивают за себя страховые взносы в соответствии со ст. 4.5 Федерального закона.
Пунктом 2 ч. 2 ст. 3 Федерального закона установлено, что пособие по временной нетрудоспособности в случае утраты трудоспособности вследствие заболевания или травмы выплачивается указанным лицам за счет средств бюджета Фонда социального страхования Российской Федерации с 1-го дня временной нетрудоспособности.
Статьей 217 Кодекса предусмотрены случаи освобождения от обложения налогом на доходы физических лиц определенных видов доходов.
В соответствии с п. 1 ст. 217 Кодекса от обложения налогом на доходы физических лиц освобождаются государственные пособия, за исключением пособий по временной нетрудоспособности (включая пособие по уходу за больным ребенком), а также иные выплаты и компенсации, выплачиваемые в соответствии с действующим законодательством. При этом к пособиям, не подлежащим налогообложению, относятся пособия по безработице, беременности и родам.
Таким образом, пособия по временной нетрудоспособности, в том числе выплачиваемые индивидуальному предпринимателю, добровольно вступившему в отношения по обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством и уплачивающему за себя страховые взносы в соответствии со ст. 4.5 Федерального закона, подлежат обложению налогом на доходы физических лиц в общеустановленном порядке.
Обязанности по исчислению и уплате налога на доходы физических лиц возлагаются в соответствии со ст. 226 Кодекса на организацию, от которой или в результате отношений с которой налогоплательщик получил указанный доход.