Полномочия обособленного подразделения на ведение отдельного баланса, а также начисление выплат и иных вознаграждений в пользу физических лиц могут быть прописаны в положении об обособленном подразделении, уставе юридического лица, доверенности, выданной юридическим лицом руководителю обособленного подразделения, что может являться подтверждением наличия у обособленного подразделения юридического лица отдельного баланса и начисления выплат и иных вознаграждений в пользу физических лиц.
Наличие расчетного счета у обособленного подразделения юридического лица может быть подтверждено справкой об открытии указанного счета, выданной банком.

Особенности исчисления НДФЛ

Порядок уплаты НДФЛ зависит от того, имеет обособленное подразделение расчетный счет и отдельный баланс или нет. Если таковые имеются и обособленное подразделение выплачивает доход физическим лицам, то подразделение уплачивает налог самостоятельно (Письма Минфина России от 18.06.2010 N 03-04-06/3-124, от 24.08.2009 N 03-04-06-01/219). В противном случае НДФЛ исчисляет, удерживает и перечисляет головная организация или ее уполномоченный представитель (им может быть другое обособленное подразделение, имеющее расчетный счет и отдельный баланс) (Письма Минфина России от 29.03.2010 N 03-04-06/54, от 29.03.2010 N 03-04-06/55, от 28.08.2009 N 03-04-06-01/224).

Особенности исчисления страховых взносов

Обособленное подразделение самостоятельно уплачивает страховые взносы, если обладает следующими признаками (ч. 11, 14 ст. 15 Закона N 212-ФЗ, Письмо ФСС РФ от 05.05.2010 N 02-03-09/08-894п):

1 — наличие отдельного баланса.

2 — наличие расчетного счета;

3 — обособленное подразделение начисляет выплаты и иные вознаграждения физическим лицам;

4 — обособленное подразделение расположено на территории Российской Федерации.

Если обособленное подразделение самостоятельно исчисляет и уплачивает платежи в бюджеты внебюджетных фондов, то головная организация уплачивает страховые взносы в следующем порядке:

1) определяет общую сумму страховых взносов к уплате по всей организации в целом;

2) из полученной суммы вычитается величина страховых взносов, которую должны уплатить обособленные подразделения по месту своего нахождения;

3) полученная разница подлежит перечислению в бюджеты внебюджетных фондов по месту нахождения головной организации.

Кроме того, обособленные подразделения самостоятельно исчисляют и уплачивают страховые взносы, если они имеют отдельный баланс, расчетный счет и начисляют выплаты физическим лицам (абз. 3 ст. 6 Закона N 125-ФЗ).

Если обособленное подразделение не имеет счета, отдельного баланса, то расчеты производит головная организация.

Особенности исчисления налога на прибыль

Особенности исчисления налога на прибыль обособленными подразделениями установлено в статье 288 НК РФ. Налогоплательщики производят уплату налога без распределения сумм по обособленным подразделениям. Уплата авансовых платежей из обособленных подразделений осуществляется исходя из доли прибыли, приходящейся на эти обособленные подразделения, определяемой как средняя арифметическая величина удельного веса среднесписочной численности работников (расходов на оплату труда) и удельного веса остаточной стоимости амортизируемого имущества этого обособленного подразделения соответственно в среднесписочной численности работников (расходах на оплату труда) и остаточной стоимости амортизируемого имущества.

Если налогоплательщик имеет несколько обособленных подразделений на территории одного субъекта Российской Федерации, то распределение прибыли по каждому из этих подразделений может не производиться на основании п.2 ст.288 НК РФ. Таким образом, уплата налога на прибыль в Московской области может быть возложена на одно структурное подразделение.

По итогам каждого отчетного (налогового) периода необходимо (п. 1, 2 ст. 288, абз. 1 п. 1 ст. 289 НК РФ):

1. Определять прибыль (налоговую базу) в целом по организации.

2. Определять долю прибыли (налоговую базу) обособленного подразделения в общей прибыли (налоговой базе) организации (абз. 1 п. 2 ст. 288 НК РФ).

3. Уплачивать авансовые платежи и налог:

1) в федеральный бюджет — по месту нахождения головного офиса (п. 1 ст. 288 НК РФ);

2) в бюджет субъекта РФ — по месту нахождения головного офиса и обособленного подразделения (п. 2 ст. 288 НК РФ).

При этом перечисление авансовых платежей (налога) в бюджет субъекта РФ может осуществлять сама организация либо обособленное подразделение (если оно имеет расчетный счет).

4. Представлять декларацию по налогу на прибыль в налоговые органы по месту нахождения головного офиса и обособленного подразделения (абз. 1 п. 1 ст. 289 НК РФ).

Особенности исчисления налога на имущество

Если обособленное подразделение организации имеет отдельный баланс и на нем числится движимое имущество, то налог в отношении его нужно уплачивать по месту нахождения данного подразделения (ст. 384 НК РФ).

При наличии нескольких обособленных подразделений с отдельным балансом платить налог нужно по месту нахождения каждого из них (Письмо Минфина России от 26.02.2004 N 04-05-06/19).

Если же обособленное подразделение организации не выделено на отдельный баланс, налог в отношении движимого имущества уплачивается (п. 3 ст. 383, ст. 384 НК РФ):

— по месту нахождения организации либо

— по месту нахождения другого обособленного подразделения, на балансе которого учтено данное имущество.

Особенности исчисления НДС

Сумма НДС, подлежащая уплате в бюджет, по операциям реализации (передачи, выполнения, оказания для собственных нужд) товаров (работ, услуг) на территории Российской Федерации уплачивается по месту учета налогоплательщика. При этом распределение сумм налога по обособленным подразделениям не производится. Декларация представляется только по месту нахождения головной организации.

Обособленные подразделения могут самостоятельно оформлять счета-фактуры от имени организации. При заполнении счетов-фактур по товарам, реализованным подразделениями, в строке 2б «ИНН/КПП продавца» указывается КПП соответствующего подразделения (Письма Минфина России от 20.04.2007 N 03-07-11/114 и 04.05.2006 N 03-04-09/08).