ВАС РФ поддержал Минфин в части учета неотделимых улучшений. Капвложения, которые арендатор производит в виде неотделимых улучшений в арендованную недвижимость и учитывает в составе основных средств, облагаются налогом на имущество до их выбытия в рамках договора аренды. По мнению Минфина, под указанным выбытием, среди прочего, следует понимать возмещение арендодателем стоимости таких улучшений (за исключением случая, когда их сумма учитывается в счет арендной платы).Было вынесено соответствующее Решение Высшего Арбитражного Суда РФ от 27 января 2012 г. N 16291/11 «О признании недействительным письма Минфина России».

До того, как имущество с неотделимыми улучшениями возвращается арендодателю, или до возмещения им произведенных расходов именно арендатор признается лицом, которое произвело такие капвложения, приносящие ему экономическую выгоду.
Поэтому именно на нем и лежит обязанность отражать их в бухучете в составе основных средств и, соответственно, платить налог на имущество в отношении них.

Оспариваемое письмо Минфина России было направлено Федеральной
налоговой службе для руководства в ее практической деятельности, что не
исключает возможности многократного применения содержащихся в нем
предписаний, порождает правовые последствия для неопределенного круга лиц
и должно быть использовано в работе налоговых органов при проведении ими
мероприятий налогового контроля.
При таких обстоятельствах суд приходит к выводу, что оспариваемое
письмо является актом, принятым (изданным) федеральным органом
исполнительной власти, уполномоченным осуществлять функции по выработке
государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере
налогов и сборов, и содержит общеобязательные предписания, рассчитанные
на многократное применение.
С учетом изложенного ходатайство Минфина России о прекращении
производства по делу не подлежит удовлетворению.
Выслушав представителей сторон, изучив и оценив представленные
сторонами доказательства, суд установил следующее.
В оспариваемом письме изложена позиция Минфина России, против
которой выступает заявитель, о том, что капитальные вложения,
произведенные арендатором в виде неотделимых улучшений в арендованные
объекты недвижимого имущества, учтенные в составе основных средств
арендатора, возмещаемые (невозмещаемые) арендодателем, подлежат обложению
налогом на имущество организаций до их выбытия в рамках договора аренды.

www.garant.ru