В соответствии с абз. 4 п. 27 ст. 217 Кодекса в редакции, действующей с 1 января 2009 г., не подлежат обложению налогом на доходы физических лиц доходы в виде процентов по рублевым вкладам, которые на дату заключения либо продления договора были установлены в размере, не превышающем действующую ставку рефинансирования Банка России, увеличенную на пять процентных пунктов, при условии, что в течение периода начисления процентов размер процентов по вкладу не повышался и с момента, когда процентная ставка по рублевому вкладу превысила ставку рефинансирования Банка России, увеличенную на пять процентных пунктов, прошло не более трех лет.

Таким образом, в случае, если процентная ставка по вкладу на дату заключения договора превышает ставку рефинансирования Банка России, увеличенную на пять процентных пунктов, процентные доходы по такому вкладу подлежат налогообложению с определением налоговой базы в соответствии со ст. 214.2 Кодекса.

Согласно ст. 214.2 Кодекса в отношении доходов в виде процентов, получаемых по вкладам в банках, налоговая база определяется как превышение суммы процентов, начисленной в соответствии с условиями договора, над суммой процентов, рассчитанной по рублевым вкладам исходя из ставки рефинансирования Банка России, увеличенной на пять процентных пунктов, действующей в течение периода, за который начислены указанные проценты.

В соответствии с п. 3 ст. 226 Кодекса исчисление сумм налога производится налоговыми агентами нарастающим итогом с начала налогового периода по итогам каждого месяца применительно ко всем доходам, в отношении которых применяется налоговая ставка, установленная п. 1 ст. 224 Кодекса, начисленным налогоплательщику за данный период, с зачетом удержанной в предыдущие месяцы текущего налогового периода суммы налога.

Сумма налога применительно к доходам, в отношении которых применяются иные налоговые ставки, исчисляется налоговым агентом отдельно по каждой сумме указанного дохода, начисленного налогоплательщику.

Абзацем 3 п. 2 ст. 224 Кодекса в отношении процентных доходов по вкладам в банках, подлежащих налогообложению, налоговая ставка установлена в размере 35 процентов.

Таким образом, суммы налога на доходы физических лиц с доходов в виде процентов по вкладу должны исчисляться и удерживаться налоговым агентом отдельно по каждой сумме соответствующего дохода, определяемого на дату его выплаты.

Такой неутешительный вывод содержится в письме Минфина от 16 мая 2011 г. N 03-04-05/6-356