При оплате организацией комиссии банку за перечисление своему работнику суммы займа на банковскую карту НДФЛ не начисляется (Письмо Минфина России от 13.02.2017 N 03-04-06/7825)
За совершение указанной операции банк взимает с организации комиссию за услуги по безналичным операциям по счету организации, предусмотренную договором на расчетно-кассовое обслуживание, заключенным между банком и организацией.
Согласно статье 41 Кодекса в целях налога на доходы физических лиц доходом признается экономическая выгода в денежной или натуральной форме, учитываемая в случае возможности ее оценки и в той мере, в которой такую выгоду можно оценить, и определяемая в соответствии с главой «Налог на доходы физических лиц» Кодекса.
Поскольку договором займа предусмотрено, что заем будет предоставлен путем зачисления соответствующей суммы на банковскую карту физического лица — заемщика, какой-либо дополнительной экономической выгоды в связи с оплатой организацией комиссии банку за совершение такой операции по счету организации у заемщика не возникает.
Соответственно, у физического лица — заемщика не возникает объекта налогообложения — дохода.