Если стоимость квартиры, указанная в договоре мены, равна сумме расходов на ее приобретение, налоговая база по налогу на доходы физических лиц будет равна нулю.
Статьей 567 Гражданского кодекса Российской Федерации определено, что к договору мены применяются соответственно правила о купле-продаже, если это не противоречит правилам гл. 31 Гражданского кодекса Российской Федерации и существу мены. При этом каждая из сторон признается продавцом товара, который она обязуется передать, и покупателем товара, который она обязуется принять в обмен.
В соответствии с п. 1 ст. 568 Гражданского кодекса Российской Федерации, если из договора мены не вытекает иное, товары, подлежащие обмену, предполагаются равноценными.
Сумма дохода, полученного по договору мены квартиры, определяется исходя из стоимости передаваемой квартиры, указанной в договоре мены.
Согласно пп. 1 п. 1 ст. 220 Кодекса налогоплательщик при определении размера налоговой базы по налогу на доходы физических лиц имеет право на получение имущественных налоговых вычетов, в частности, в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 руб.
Вместо использования права на получение имущественного налогового вычета, предусмотренного данным подпунктом, налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с получением этих доходов.
Поскольку суммы субсидии, направленные налогоплательщиком на приобретение квартиры, являются расходами данного налогоплательщика, то при продаже квартиры, находившейся в собственности налогоплательщика менее трех лет, он имеет право уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на всю сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением данной квартиры.
Данный вывод содержится в письме Минфина от 16 ноября 2011 г. N 03-04-05/7-896

Правильно Разгулин С.В. объяснил.
Получателем дохода по мене является сторона считающаяся продавцом.
При этом она получает доход в виде полученной ею квартиры. (денег нет, обмен равноценный).
Расходом продавца, связанным с получением этого дохода, является встречное предоставление своей квартиры, цена которой указана в договоре мены.(денег нет, обмен равноценный).
Документальным подтверждением такого расхода является сам договор мены (с ценой) и акт передачи квартиры продавца покупателю.
> Документальным подтверждением такого расхода является сам договор мены
Это где такое написано?
В письме письме Минфина от 16 ноября 2011 г. N 03-04-05/7-896 предлагается использовать в качестве расходов на приобретение квартиры сумму субсидии + собственные средства, которые пошли на покупку. Т.е. затраты понесенные до договора мены (=продаже квартиры и покупке новой).
Получается, что если вы владеете квартирой больше 3-лет и не воспользовались вычетом на покупку, то можно скостить налоги на 260 тыс.
А если меньше 3 лет и уже воспользовались вычетом на покупку, то надо платить налог на стоимость обмениваемого имущества.
А в письме УФНС РФ по г. Москве от 30.12.2009 N 20-15/4/139525 прямо написано
»
Вместе с тем налогоплательщик (покупатель квартиры) по договору мены без доплаты не вправе получить имущественный налоговый вычет, предусмотренный в пп. 2 п. 1 ст. 220 НК РФ, поскольку отсутствуют фактически произведенные и документально подтвержденные расходы, связанные с покупкой квартиры.
»
Доход нет, одни налоги
Парадокс…
Договорные условия (то есть подтверждением договорных отношений именно мены) будет являться договор, который вы сможете предъявить в суде. Правовое регулирование мены и ее документального подтверждения вы можете найти в ГК РФ. Вы как раз сами ответили на свой вопрос о том, что в письме УФНС также говорится, что налогоплательщик подтверждает свой вычет на основании договора. Также договор будет являться основанием для регистрации прав на собственность и получения свидетельства о собственности.