Налогообложение представительства государственного бюджетного учреждения будет осуществляться путем уплаты авансовых платежей по налогу на прибыль по общей ставке 20%. Налогообложение представительства в соответствии с законодательством РФ будет осуществляться с 1 января 2015 года.

Пункт 3 ст. 286 Налогового кодекса РФ позволяет отдельным категориям налогоплательщиков уплачивать только квартальные авансовые платежи (без уплаты ежемесячных) по итогам отчетного периода. К таким организациям относятся бюджетные учреждения.

Таким образом, в отношении деятельности, приносящей доход, государственное бюджетное учреждение уплачивает налог по общей ставке 20% ежеквартально (п. 1 ст. 284 НК РФ).

Вместе с тем, в отношении налогообложения представительства в г. Севастополе необходимо учитывать следующее.

На основании ст. 15 Федерального конституционного закона от 21 марта 2014 г. N 6-ФКЗ «О принятии в Российскую Федерацию Республики Крым и образовании в составе Российской Федерации новых субъектов — Республики Крым и города федерального значения Севастополя» законодательство Российской Федерации о налогах и сборах применяется на территориях Республики Крым и города федерального значения Севастополя с 1 января 2015 г.

Законодательство Российской Федерации о налогах и сборах применяется на территориях Республики Крым и города федерального значения Севастополя с 1 января 2015 года.

До 01.01.2015 на территориях Республики Крым и города федерального значения Севастополя отношения по установлению, введению и взиманию налогов и сборов, в том числе по установлению налоговых льгот, а также отношения, возникающие в процессе осуществления налогового контроля, обжалования актов налоговых органов, действий (бездействия) их должностных лиц и привлечения к ответственности за совершение налогового правонарушения, регулируются нормативными правовыми актами Республики Крым и города федерального значения Севастополя (Письмо ФНС России от 04.04.2014 N ГД-4-3/6133).

До указанной даты обособленное подразделение российского юридического лица не подлежит постановке на учет в территориальных органах ФНС России на территории Республики Крым и города федерального значения Севастополя.

Следовательно, налогообложение в отношении представительства будет осуществляться с 1 января 2015 года.