В определении ВАС РФ от 21.06.2010 N ВАС-7613/10 по делу N А56-15894/2008 суд встал на сторону налогоплательщика.

Судом было установлено, что налоговым органом не проверялся вопрос о произведенных учреждением расходах. Суд кассационной инстанции признал, что доначисление налога на прибыль без учета произведенных расходов противоречит положениям статей 247 и 321.1 НК РФ и влечет неправильное определение инспекцией размера налоговых обязательств учреждения.

Признавая неправомерным доначисление учреждению НДС по названному эпизоду, суды исходили из того, что материалами дела подтверждается и не оспаривается налоговым органом тот факт, что указанный налог был доначислен без учета сумм налога, уплаченного арендаторами.