Кому непосредственно должен подчиняться специалист?

Структуру и штатное расписание организации утверждает генеральный директор.

В соответствии со структурой и штатным расписанием определяется подчиненность работника конкретному руководителю. Существенными условиями, которые необходимо учитывать при принятии решения об изменении внутренней структуры организации, являются следующие:
— указано ли в трудовом договоре структурное подразделение, в котором работает работник;
— изменяется ли трудовая функция работника;
— изменяется ли наименование структурного подразделения.
Штатное расписание является обязательным документом в компании. Согласно статье 15 ТК РФ трудовые отношения регулируются в том числе штатным расписанием.
Для разработки штатного расписания возможно воспользоваться собственной формой или использовать унифицированную форму N Т-3 (утв. Постановлением Госкомстата РФ «Об утверждении унифицированных форм первичной учетной документации по учету труда и его оплаты» от 05.01.2004 N 1).
Алгоритм составления штатного расписания следующий:
1. Назначьте ответственного работника за составление штатного расписания.
2. Заполните основные реквизиты штатного расписания:
— наименование организации указывается в точном соответствии с учредительными документами;
— код по ОКПО содержит 8-разрядный идентификационный код предприятия или организации;
— «Номер документа»;
— дата составления указывается текущая;
— в строке «На период» указывается период действия штатного расписания;
— в гриф утверждения документа вносятся реквизиты приказа по основной деятельности, которым был утвержден данный документ.
После определения структуры и штатного расписания, необходимо внести изменения в трудовой договор. Вместе с тем, за деятельность организации отвечает генеральный директор, как руководитель экономического субъекта согласно закону 402-ФЗ «О бухгалтерском учете»