Как выгоднее выплачивать зарплату единственному учредителю?

Существует несколько способов:
Первый: зарплата по трудовому договору. Если единственный учредитель является директором, то он одновременно
является и работником компании. Соответственно, с ним должен быть заключен трудовой договор, по которому выплачивается зарплата. Трудовой кодекс не предусматривает никаких исключений, даже для владельцев компаний.
Сумма зарплаты уменьшает налогооблагаемую прибыль (ст. 255 НК РФ) и облагается страховыми взносами (ст. 7 ФЗ от
24.07.09 № 212-ФЗ). НДФЛ с работника — резидента РФ взимается по ставке 13 %.
Второй: разовые вознаграждения без заключения трудового договора. По мнению Минздравсоцразвития РФ и со ссылкой
на письмо от 18.08.09 № 22-2-3199, невозможно заключить трудовой договор между директором и учредителем в одном
лице. Единственный участник возлагает на себя функции руководителя и осуществляет управленческую деятельность
без заключения какого-либо договора, в том числе и трудового. Этим мнением руководствуются и проверяющие
(письмо ФНС России от 16.09.09 № ШС-17-3/168@ «О направлении письма Минфина России от 07.09.09 № 03-04-07-
02/13»). При отсутствии трудового договора вознаграждение руководителя не признается налоговым расходом (п. 21 ст.
270 НК РФ). Страховых выплат в этом случае тоже не возникнет, поскольку нет как такового объекта обложения.
Подобное мнение высказывал Минфин РФ в отношении ЕСН в письме от 07.09.09 № 03-04-07-02/13, но для страховых
взносов уместным будет применить такая же логика. НДФЛ при этом взимается по ставке 13%, в случае, если учредитель
является резидентом РФ.
Третий: выплата дивидендов. Поскольку директор является единственным учредителем, то он вместо вознаграждения за
труд может получать дивиденды. Они выплачиваются за счет чистой прибыли и не облагаются страховыми взносами. Ставка НДФЛ для резидента РФ — 9% (п. 4 ст. 224 НК РФ).
Четвёртый: оплата услуг ИП, управляющего компанией. Единственный учредитель не всегда занимает должность
директора, он может быть зарегистрирован в качестве ИП и оказывает услуги по управлению. При применении УСН с
объектом «доходы» налоговая нагрузка с его вознаграждения минимальна — 6% и стоимость страхового года (ст. 13 закона
№ 212-ФЗ). Однако последний будет, скорее всего, уплачен за счет уменьшения единого налога (п. 3 ст. 346.21 НК РФ) и нагрузку он не увеличит.
Из книги Черная и белая оптимизация налогов.