Применяющий УСН индивидуальный предприниматель исполняет обязанности налогоплательщика по месту жительства, даже если он осуществляет деятельность в другом муниципальном образовании (Письмо Минфина России от 16.10.2012 N 03-11-11/309).

В соответствии с пп. 2 п. 1 ст. 23 Кодекса налогоплательщики обязаны встать на учет в налоговых органах, если такая обязанность предусмотрена Кодексом.
При этом согласно п. 1 ст. 83 Кодекса в целях проведения налогового контроля физические лица подлежат постановке на учет в налоговых органах по месту жительства физического лица, а также по месту нахождения принадлежащих ему недвижимого имущества и транспортных средств и по иным основаниям, предусмотренным Кодексом.
При использовании общего режима налогообложения налоговая декларация представляется каждым налогоплательщиком по каждому налогу, подлежащему уплате этим налогоплательщиком, если иное не предусмотрено законодательством о налогах и сборах, по месту учета налогоплательщика в налоговых органах.
При применении упрощенной системы налогообложения согласно п. 6 ст. 346.21 и п. 2 ст. 346.23 Кодекса индивидуальный предприниматель представляет налоговую декларацию и производит уплату налога и авансовых платежей по месту жительства индивидуального предпринимателя.
Таким образом, индивидуальный предприниматель, применяющий упрощенную систему налогообложения, проживающий и состоящий на налоговом учете в одном муниципальном образовании, независимо от того, что он осуществляет предпринимательскую деятельность в другом муниципальном образовании, обязан в установленном порядке исчислять и перечислять налоги в бюджет по месту жительства (регистрации), а также исполнять другие обязанности налогоплательщика, предусмотренные ст. 23 НК РФ.